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精神疾病,站在遺傳與環(huán)境的十字路口

前沿科技 3年前 (2022) 虛像
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精神疾病,站在遺傳與環(huán)境的十字路口

1980 年 DSM- Ⅲ的問世拉開了精神疾病定義革命的序幕,精神疾病回歸到克雷佩林的現(xiàn)象學分類傳統(tǒng) *,而不再以無法言明的病因劃分。這對于精神疾病的診斷來說意義重大,但也帶來了新的問題:病因的異質(zhì)性,即同一疾病可能存在多樣的病因。

* 譯者注

埃米爾 · 克雷佩林(1856 年— 1926 年)根據(jù)精神疾病的癥狀對其進行了具有里程碑意義的分類,著有《精神病學綱要》(Compendium der Psychiatrie)。這一思路與同時代的弗洛伊德的形成鮮明對比,后者強調(diào)基于心理學病因的分類方法。

傳統(tǒng)的遺傳學方法在這里失靈:很多精神疾病雖然有家族傳播的傾向,但并不嚴格遵循孟德爾定律(常染色體或 X- 連鎖,顯性或隱形);全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)在阿爾茨海默病等復(fù)雜疾病中表現(xiàn)優(yōu)異,在精神疾病中卻不盡如人意。精神疾病的發(fā)病不僅受基因控制,也與環(huán)境高度相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),與單純的遺傳多變性相比,基因 - 環(huán)境相互作用(G×E)才是帶來病因異質(zhì)性的遺傳學核心 [ 1,2 ] 。

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G×E:基因 - 環(huán)境互作研究

為了探究復(fù)雜疾病的病因,科學家們將傳統(tǒng)遺傳學和流行病學研究相結(jié)合,形成了遺傳流行病學,而 G×E 正是其中的核心概念 [ 3 ] 。環(huán)境與基因均會影響疾病癥狀,除去基因型和環(huán)境因素分別單獨作用外:環(huán)境因素對不同個體的作用會受基因型影響;遺傳因素的作用也取決于環(huán)境的影響。G×E 指的就是這二者的相互作用。

但 G×E 的研究非常困難,相比于 GWAS 等單純的基因研究,環(huán)境變量的引入是一個巨大的統(tǒng)計學難題。一般來說,一個理想的 G×E 數(shù)據(jù)庫應(yīng)該包括以下特征 [ 4 ] :

(1)包含大量個體的完整胚系基因組序列,且所有個體可鏈接到一個統(tǒng)一的遺傳家系,以實現(xiàn)垂直性狀傳播的推斷分析;

胚系基因組 ( Germline genomics ) :指未發(fā)生重排的生殖細胞基因組,與體細胞基因組相對。

(2)包含所有個體的完整表型概況,包含動態(tài)變化。而這是極具挑戰(zhàn)性的。目前,最好的人類觀察數(shù)據(jù)包含每個個體的病史記錄、臨床檢測記錄、生物代謝特征等,但能捕捉的個體發(fā)育片段非常有限;

(3)包含外部環(huán)境事件和環(huán)境干預(yù)的完整記錄,包括多種多樣的氣候變化、微生物穩(wěn)態(tài)的波動、個人的生活習慣和社交結(jié)構(gòu)等等。環(huán)境條件的動態(tài)記錄數(shù)據(jù)相比遺傳信息更加龐大,因為環(huán)境參數(shù)的集合極其龐大,并且必須從受孕到死亡不間斷地進行記錄。

精神疾病,站在遺傳與環(huán)境的十字路口

- Tianhua Mao -

這無疑是一個包含基因型、環(huán)境、表型、時間四個維度的龐大矩陣,我們可以通過它建立復(fù)雜的數(shù)學模型,實現(xiàn) G×E 對表型的擬合。但短期之內(nèi)注定無法實現(xiàn)這樣的數(shù)據(jù)集構(gòu)建。

在近日發(fā)表于 Cell Reports Medicine 的題為 "Gene-environment interactions explain a substantial portion of variability of common neuropsychiatric disorders" 的研究中,作者借助結(jié)構(gòu)簡化的數(shù)據(jù)集和具有強大簡化假設(shè)的數(shù)學模型,分析了十個高發(fā)的神經(jīng)精神狀態(tài)中 G×E 的貢獻,包括抑郁癥、焦慮恐懼癥、偏頭痛、適應(yīng)性障礙、藥物濫用、注意缺陷多動障礙(ADHD)、雙相情感障礙、不明原因頭痛、睡眠障礙和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙(PTSD) [ 4 ] 。

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論文題目:

Gene-environment interactions explain a substantial portion of variability of common neuropsychiatric disorders

DOI:

https://doi.org/10.1016/j.nicl.2022.102969

本研究的結(jié)果

本研究收集了 138,383 個美國家庭,404,475 位個體的臨床數(shù)據(jù),家系研究,地理空間,社會經(jīng)濟因素,人口混雜因素,以及一系列的環(huán)境整合參數(shù)。針對這些參數(shù),作者設(shè)計了一系列的貝葉斯回歸模型,探究了(1)G×E 在精神疾病中的參與度;(2)不同環(huán)境因素(地理位置、性別、年齡和當?shù)丨h(huán)境質(zhì)量)對多種精神疾病發(fā)病可能性的具體關(guān)聯(lián)。論證了 G×E 在精神疾病中的重要性,也為認識這些精神疾病提供了部分指導(dǎo)。

引入 G×E 參數(shù)后,擬合度更優(yōu)

本研究取遺傳率(h2)和五種環(huán)境因素(配偶 c2,同胞 s2,家庭環(huán)境 f2,個人環(huán)境 e2、地理環(huán)境 p2)為基本參數(shù)構(gòu)建了線性多因素回歸模型,將遺傳率與環(huán)境因素交叉構(gòu)成 G×E 參數(shù)(hf2,hc2,hs2 和 he2),結(jié)合上述參數(shù)構(gòu)建混合效應(yīng)貝葉斯模型。對比發(fā)現(xiàn),含有 G×E 參數(shù)的模型對疾病的擬合度在大多數(shù)疾病中都顯著優(yōu)于線性模型。

擬合度變化:在抑郁癥,焦慮恐懼癥,偏頭痛,ADHD,雙相情感障礙,不明原因頭痛,睡眠障礙和 PTSD 八種疾病中,含有 G×E 參數(shù)的模型優(yōu)勢明顯。

遺傳率變化:在 ADHD 和雙相情感障礙種,如果不考慮 G×E 參數(shù),疾病的遺傳率會被顯著高估。

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地理位置的影響

ADHD 和 PTSD 的地理差異對整體差異的影響較大。生活在美國南部和五大湖地區(qū)患 ADHD 風險較高;西海岸和新英格蘭地區(qū)居民患 PTSD 風險較高;

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性別、年齡的影響

男性患 ADHD 和藥物濫用的風險高,女性患偏頭痛、未具體說明的復(fù)發(fā)性頭痛和 PTSD 的風險高。睡眠障礙在老年人群中更普遍。ADHD 和雙相障礙在年輕人群中較常見。

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環(huán)境質(zhì)量指標(EQI)的影響

空氣質(zhì)量差的地區(qū),抑郁癥、適應(yīng)障礙、ADHD 和雙相情感障礙的風險似乎較高,焦慮癥、不明復(fù)發(fā)性頭痛、睡眠障礙和 PTSD 的風險似乎較低。

水質(zhì)對這些精神疾病的影響很小。較低的社會人口質(zhì)量可能與抑郁、適應(yīng)障礙和 ADHD 的風險升高有關(guān),也可能與不明復(fù)發(fā)性頭痛的風險降低有關(guān)。建筑環(huán)境質(zhì)量影響廣泛:抑郁癥、適應(yīng)障礙、藥物濫用、ADHD、雙相情感障礙和睡眠障礙的發(fā)病率受到較差建筑環(huán)境質(zhì)量的影響。

EQI:每個縣的空氣、水、土地、社會人口和建筑環(huán)境五個領(lǐng)域的質(zhì)量評估指數(shù)。

延申:G×E 的研究范式

G×E 是一個典型的交叉領(lǐng)域,研究范式仍在探索中,常見的研究范式包括:

(1)多元統(tǒng)計回歸分析,檢測 G×E 的解釋效力(本研究的思路原型);

經(jīng)典的研究方法。在前全基因組數(shù)據(jù)時代,家系研究的行為遺傳學方法被用于估計遺傳和環(huán)境對癥狀的影響。但這一方案計算出的遺傳率通常比 GWAS 的結(jié)果低。

本研究創(chuàng)新性地結(jié)合雙胞胎研究、家系研究和 GWAS,但整體思路仍屬于這類。

(2)通過關(guān)聯(lián)分析確定候選基因,與環(huán)境參數(shù)進行互作研究(cGxE);

GWAS 已經(jīng)為復(fù)雜疾病遺傳學確定了數(shù)千個相關(guān)的基因突變位點。可重點研究這些候選基因與環(huán)境的關(guān)系。如癡呆患者的 APOE 突變和環(huán)境因素的相互作用研究,肥胖的相關(guān)基因 FTO 與環(huán)境的相互作用研究等。但這種研究的假陽性問題比較嚴重。

(3) 使用 GWAS 中的 PGS,測試不同環(huán)境的表現(xiàn);

多基因得分(PGS)在 GWAS 中指多個遺傳變異與表型關(guān)系的總和。2014 年前后至今,大量的 GxE 研究借助 PGS 展開,在精神疾病領(lǐng)域大有作為。通常采用病例對照研究,如多項研究調(diào)查了重度抑郁癥(MDD)的 PGS 和童年創(chuàng)傷的交互作用。有研究發(fā)現(xiàn),MDD 的 PGS 較高且經(jīng)歷過童年創(chuàng)傷的個體比那些 PGS 較低且無創(chuàng)傷病史的個體更容易發(fā)展為抑郁癥。

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我國的 G×E 數(shù)據(jù)庫—— CHIMGEN

中國影像遺傳學(Chinese Imaging Genetics, CHIMGEN)的目標是收集來自 21 個中國大陸城市的 30 個研究中心的 10000 名 18-30 歲健康漢族受試者的基因,神經(jīng)影像,環(huán)境和行為學數(shù)據(jù)。迄今為止,我們已經(jīng)招募了 7000 余名受試者,建立了全球最大樣本的中國漢族人群影像遺傳學隊列,旨在研究與神經(jīng)影像和行為表型相關(guān)的遺傳和環(huán)境因素及其相互作用。

CHIMGEN 研究的一個獨特方面是從衛(wèi)星圖像和國家調(diào)查數(shù)據(jù)庫中收集了數(shù)百個宏觀環(huán)境測量數(shù)據(jù)。與基于問卷和自我報告數(shù)據(jù)的微觀環(huán)境評估相比,遙感和國家調(diào)查數(shù)據(jù)可以提供許多新的定量宏觀環(huán)境評估。可以基于遙感數(shù)據(jù)獲得每個參與者的居住地的地貌和地形,城市化,氣候和空氣質(zhì)量的定量環(huán)境測量,以及基于國家調(diào)查數(shù)據(jù)庫的參與者生活場所的經(jīng)濟,城市化,生活條件,醫(yī)療保健和教育的定量環(huán)境測量。

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CHIMGEN 隊列公布的 5819 名受試者的分布、行為和基于問卷的環(huán)境數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制 [ 5 ]

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CHIMGEN 隊列中來自遙感和國家統(tǒng)計數(shù)據(jù)的環(huán)境變量 [ 5 ]

CHIMGEN 的未來規(guī)劃是收集 2000-3000 名嚴重精神障礙患者,并通過后續(xù)隨訪受試者,將 CHIMGEN 隊列發(fā)展為縱向隊列,這將為中國的精神疾病的 G×E 研究乃至病因研究帶來長遠的影響。

正如本文作者 Rzhetsky 提到的," 遺傳學被許多人視為一種判決—你無法改變它,…… 找到這些基因 - 環(huán)境相互作用給了我們希望,我們可以找到一些與環(huán)境相互作用的遺傳變異,這樣,理想情況下,你可以改變你的環(huán)境來避免疾病。"

我們相信,對環(huán)境的修飾和干預(yù)終將為精神疾病的精準醫(yī)療拓寬道路。

原文地址:http://www.myzaker.com/article/634920458e9f090eb02bd0fb

版權(quán)聲明:虛像 發(fā)表于 2022年10月14日 pm7:36。
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